Após a cirurgia, as pessoas continuam a levar uma vida normal, mas, de acordo com a Clínica Mayo, alguns efeitos colaterais ocorrem imediatamente após o procedimento, como diarreia causada pela irritação das fezes devido ao fluxo de bile diretamente para os intestinos na ausência da vesícula biliar, e inchaço abdominal.
As complicações , que são relativamente raras porque o procedimento é considerado seguro, incluem sangramento, lesão do ducto biliar, vazamento de bile, trombose venosa profunda ou lesão nos intestinos, vísceras e vasos sanguíneos.